تتنوع اللجان العلمية بالقسم بحسب طبيعة العمل بالكلية فالبعض منها لجان مشتركة على مستوى الكلية مثل اللجان الامتحانية وهذه يشترك فيها جميع اعضاء هيئة التدريس بالقسم، و لجنة المعادلات العلمية ولجان التحقيق و مجالس التأديب ولجان المراجعة و الرصد ولجنة الدراسات العليا بالكلية ولجان دراسة واعداد اللوائح الداخلية الجامعية والعليا وهذه اللجان يختار السيد العميد من يكون في رئاستها وعضويتها.
وهناك لجان خاصة بعمل القسم مثل لجان المراجعة للمقررات التي تم الرسوب فيه والمتعلقة بمقررات القسم، ولجان مناقشة بحوث التخرج، ولجان مناقشة مقترحات وخطط الماجستير، وهذه يختارها القسم، وما يكلف به اعضاء القسم من السيد عميد الكلية أو السيد رئيس الجامعة من اعمال في لجان فنية أو علميه أخرى تقتضيها طبيعة العمل.